Bacterias intestinales forman linajes distintos vinculados a enfermedades, según un estudio
Un estudio publicado el miércoles en la revista Nature revela que muchas especies bacterianas intestinales comunes no constituyen poblaciones homogéneas y uniformes, como la ciencia había supuesto durante largo tiempo, sino que se componen de varios linajes evolutivamente distintos, algunos de los cuales están asociados al envejecimiento, a las enfermedades inflamatorias crónicas del intestino, al cáncer colorrectal y a la diabetes de tipo 2. Los resultados, obtenidos por investigadores de la Universidad de Viena, podrían transformar el modo en que los científicos estudian el microbioma y abrir el camino hacia terapias de mayor precisión.
La investigación convencional sobre el microbioma clasifica las bacterias a nivel de especie o según su similitud genética, categorías útiles para análisis a gran escala pero que pueden ocultar cuáles son las poblaciones bacterianas que realmente impulsan las enfermedades. El equipo vienés, dirigido por el responsable del estudio Martin F. Polz y la primera autora Xiaoqian Annie Yu, aplicó una metodología conocida como "ecología inversa", que deduce las adaptaciones ecológicas directamente a partir de datos genómicos en lugar de partir de rasgos observados. Este enfoque permite superar las limitaciones de la clasificación por especie e identificar distinciones más finas entre poblaciones bacterianas que de otro modo pasarían desapercibidas.
Los investigadores analizaron miles de aislados bacterianos procedentes del microbiota intestinal humano, junto con extensos conjuntos de datos metagenómicos obtenidos de personas de varios países, grupos de edad y estados de salud distintos. Buscaron firmas genéticas de "barridos selectivos a escala genómica", un proceso por el cual una bacteria adquiere una mutación ventajosa, supera en competencia a sus parientes más cercanos y genera una población genéticamente homogénea y funcionalmente diferenciada. Según explicó Yu, incluso dentro de una misma especie bacteriana, determinadas poblaciones aparecen con mayor frecuencia que otras en ciertas enfermedades, un patrón que se vuelve invisible cuando todas las poblaciones se agrupan y analizan de forma conjunta.
Uno de los hallazgos más llamativos del estudio es que los linajes bacterianos bien adaptados pueden propagarse por varios continentes en cuestión de décadas, una dinámica que hasta ahora se asociaba principalmente a agentes patógenos reconocidos. Polz señaló que los resultados demuestran que las bacterias intestinales son considerablemente más dinámicas de lo que se pensaba, con cepas bien adaptadas capaces de diseminarse a escala internacional y colonizar nuevos nichos ecológicos. Esto sugiere que el microbioma no solo está moldeado por la dieta, los medicamentos y el estilo de vida, como ha subrayado el campo durante décadas, sino también por la transmisión directa entre individuos, un factor que ha recibido mucha menos atención en los modelos estándar de microbioma.
Las consecuencias prácticas de la investigación alcanzan tanto al diagnóstico como al tratamiento. Al vincular linajes bacterianos específicos, en lugar de especies en sentido amplio, a enfermedades concretas, el estudio sienta las bases para una investigación de biomarcadores más precisa. A más largo plazo, los hallazgos podrían impulsar el desarrollo de terapias diseñadas para promover cepas beneficiosas o suprimir las perjudiciales con un nivel de especificidad que la clasificación por especie no permite alcanzar. El equipo de Viena tiene previsto continuar la investigación examinando los genes que distinguen las poblaciones identificadas y caracterizando las funciones biológicas que estos codifican.
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